蓝脑计划发布首个数字3D脑细胞图集

资源

就像“从原始卫星图像到Google Earth”一样,蓝脑细胞图集允许每个人逐个单元可视化鼠标大脑的每个区域,并免费下载数据以进行新的分析和建模。

小鼠大脑中每个细胞的第一个数字3D地图集为神经科学家提供了以前无法获得的有关737个大脑所有区域的主要细胞类型,数量和位置的信息,这可以极大地促进大脑科学的进步。被释放 EPFL的“蓝脑计划” and published 在 神经信息学前沿, 蓝脑细胞图集 将数百种全脑组织染色剂的数据整合到一个全面,交互式和动态的在线资源中,该资源可以通过新发现不断更新。这个突破性的数字地图集可用于分析和进一步建模特定的大脑区域,并且是全面模拟啮齿动物大脑的重要一步。


小鼠大脑细胞图集
► 阅读原始文章
► 下载原始文章(pdf)
► 尝试蓝脑细胞图集


“尽管在过去的一个世纪中进行了大量研究,但仍仅对4%的小鼠大脑区域提供了细胞数量-这些估计值经常相差多达三倍,” Blue Brain项目创始人兼总监说, 亨利·马克兰教授。 “这限制了我们研究和建模大脑的努力。蓝脑细胞图谱解决了这个问题,并为我们今天拥有的整个小鼠脑的所有区域提供了最佳估计。”

“知道电路组件及其布置方式是大脑建模的基本出发点,例如人口数据对于建模国家至关重要,” Cell Atlas的主要作者和创建者解释道, CsabaErö博士.

先前的脑图集由染色的脑切片的图像堆栈组成。一些显示整个大脑的精确细胞位置,而另一些显示特定的细胞类型。但是没人能将这些有价值的数据转化为大脑中所有细胞的数量和位置。

这一革命性的步骤用了五年时间完成。 Erö和同事将来自艾伦脑科学研究所的成像数据与大量其他解剖学研究相结合,以计算和验证小鼠大脑各个区域(包括细胞数据所在的所有区域)的主要类型,数量和位置以前从未获得过。

神经信息学领域的前沿领域

“我们的Cell Atlas就像从粗糙的地图和原始的卫星图像,到探索Google地球中的城市和地理特征一样,” Blue Brain部门经理说, Marc-Oliver Gewaltig博士。 “它是3D,高分辨率,可搜索,可导航,带注释,易于使用-并提供了新信息。”

蓝脑细胞图集可在线免费获得,使用户可以看到任何大脑区域中的所有细胞,并下载其编号和位置。它区分了兴奋性,抑制性和某些其他类型的神经元–以及主要类型的称为神经胶质细胞的非神经元细胞,它们可隔离和保护神经元。这些数据对于试图了解不同大脑区域的结构和功能或建立特定大脑区域的功能模型的研究人员而言是无价的。

Gewaltig补充说:“这也是一种很好的教学手段:您可以选择仅显示感兴趣的区域,并在这些区域中导航到单个细胞的比例,这些细胞按形态进行颜色编码。”

蓝脑细胞图集是动态的-允许研究人员使用任何新数据为地图集做出贡献并加以改进。

“随着新实验数据的整合,现在可以完善细胞数量,位置和亚型,” Markram解释道。

“我们给各地脑研究人员的信息是: 试试看,使用它,向其中添加数据,作者总结说。


来源文章: 小鼠大脑细胞图集

更新指南:开放访问和共享研究是其中的一部分 边境任务。除非另有说明,否则您可以重新发布在Frontiers新闻博客中发布的文章-只要您包含指向原始研究的链接即可。禁止出售物品。

关于EPFL的“蓝脑计划”

目的 EPFL的“蓝脑计划”这项由亨利·马克兰(Henry Markram)教授创立和领导的瑞士大脑计划,旨在为啮齿动物的大脑乃至人类的大脑建立准确的,生物学上详细的数字重建和模拟。由Blue Brain建立的基于超级计算机的重建和仿真为理解大脑的多层次结构和功能提供了一种全新的方法。

贡献者和资金

EPFL的“蓝脑计划”非常感谢 艾伦脑科学研究所 可获得大量公开数据。该项目已获得欧盟Horizo​​n 2020研究与创新框架计划的资助,资助协议号为604102(人脑项目加速阶段)和资助协议号为720270(人脑项目SGA1)。这项工作得到了EPFL蓝脑项目基金和ETH董事会对蓝脑项目的资助。

关于EPFL

EPFL洛桑大学是位于瑞士洛桑的两家瑞士联邦理工学院之一,是欧洲最具国际性的科技大学,拥有来自120多个国家的学生,教授和员工。 EPFL是一个向瑞士和世界开放的充满活力的环境,其主要任务是三个任务:教学,研究和技术转让。 EPFL与广泛的合作伙伴网络合作,包括其他大学和技术学院,发展中国家和新兴国家,中学和学院,工业和经济,政治界和公众,为社会带来真正的影响。

评论被关闭。

页面在0.321秒内生成。统计插件 www.blog.ca
查看我的 Stats